Las aneuploidías también pueden ocurrir en cromosomas sexuales, como es el caso del síndrome de Klinefelter. Es una mutación que genera un exceso en cromosomas X en el sexo masculino, es decir la persona que lleva esta mutación es XXY. Esta enfermedad tiene una ocurrencia de 1 en 1000 nacimientos de varones. Sus características son gran estatura, físico feminizado, bajo coeficiente intelectual, desarrollo mamario, atrofia testicular y disposición femenina del vello del pubis.

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